Santo Tomé se encuentra a sólo 4 Km de la Capital de la provincia, unida a ésta a través del puente carretero, símbolo de la ciudad. Se accede por las rutas nacionales 11, 19 y la autopista Brigadier López que la conectan con las ciudades de Santa Fe, San Francisco y Rosario respectivamente.
La ciudad se encuentra de Norte a Sur bordeada por el río Salado, siendo la única ciudad que posee un balneario a su vera. Frescura, sol pleno, tranquilidad, recreación, alternativas deportivas y culturales, todo hace al atractivo turístico de Santo Tomé.
El aeropuerto de Sauce Viejo se encuentra a 10 Km del centro de la ciudad. Sus principales arterias son las avenidas 7 de marzo y Luján en ellas se encuentra la mayor actividad comercial y de servicios, así como en las calles 25 de mayo, Mariano Candioti, Iriondo y Bv. Mitre.